1859年，江户。土方岁三沉迷于挑战各大道场比武切磋。某日，土方造访了一个名为“试卫馆”的道场。这个道场的馆主，正是后来成为新选组局长的近藤勇。土方与近藤交战，却完败于近藤那压倒性的实力之下。为了超越这种强大，土方决定拜入试卫馆门下。数年后，近藤以及试卫馆的成员们以“护卫将军”为名，参加了新组建的浪士组，并作为其中一员前往京都。当时的京都，是一个聚集了来自全国各地、怀抱着各种背景与目的之人的异样都市。佐幕派、攘夷派、倒幕派混杂其中，暗杀、阴谋、政治博弈接连不断。此后，他们与芹泽鸭一派共同组成了以镇压活动中的攘夷派志士为目的的“壬生浪士组”。壬生浪士组由芹泽与近藤共同担任局长，土方、山南以及芹泽派的新见锦担任副长。但随着时间推移，试卫馆派与芹泽派的主导权之争愈演愈烈，双方不断发生冲突，局势日趋激烈。